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1.水源一定要过滤，常用的有100目尼龙滤网或不锈钢滤网；或用120目叠片式和网式过滤器；这是滴灌系统正常运行的关键，过滤器需要定期清洗，滴灌管尾端定期打开冲洗，一般应每月至少一次.
2.施肥前先根据作物种植情况来制定施肥量，准备好肥料，在每个灌区按施肥方案准备好每次施用的肥料；施肥前先打开施肥区的开关进行灌溉，之后用肥料池溶解肥料，灌溉进行20分钟后开始施肥；每区的施肥时间在30-60分钟左右，可利用开关调节施肥速度和施肥时间.
3.肥料需选用溶解性好的，如尿素、硝酸钾、硝酸铵、氯化钾、硝酸钙、硫酸镁等；液体肥料养分含量高，溶解性好，施用方便，是喷灌系统的优选肥料；有机肥一定要沤腐后将澄清液体过滤后在放入滴灌系统中。通常要经过80目或100目两级过滤网；初次使用滴灌设施时，施肥量上可进行调整，可以“少量多次”的方法进行.
4.施肥后闭不能马上关闭滴灌系统，应留有足够的管道冲洗时间，这样做可预防管道堵塞，冲洗时间与灌溉区大小有关，滴灌一般在15-30分钟内将管道中的肥液完全排出。不然滴头处的藻类、微生物等大量繁殖会堵塞滴头孔.
5.滴灌其间要常去田间检查是否有漏水、断管、裂管等现象，滴灌系统也是需要有好的维护的.